Назначение
Анализаторы генетические капиллярного электрофореза Нанофор 05 (далее анализаторы) предназначены для определения последовательности (секвенирования) дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК).
Описание
Принцип действия анализаторов основан на методе капиллярного электрофореза - разделении веществ в жидкой полимерной фазе в тонких капиллярах под воздействием высокого напряжения. Под воздействием электрического поля отрицательно заряженные молекулы ДНК двигаются в полимере к окну детекции на противоположном конце капилляров, при этом более короткие фрагменты двигаются быстрее, чем длинные. В окне детекции происходит возбуждение пришитых к фрагментам ДНК красителей узким пучком лазера. С помощью оптической системы флуоресценция со всех капилляров собирается и проецируется на видеокамеру. С помощью программы регистрации сигналы флуоресценции разных красителей конвертируются на графиках в многоцветные пики, соответствующие четырем видам нуклеотидов, составляющих молекулу ДНК. Для распознавания оснований A, T, G, C используются 4 красителя. Объединение этих графиков при обработке программным обеспечением «ДНК Ал» позволяет расшифровать нуклеотидную последовательность ДНК.
Общий вид анализаторов представлен на рисунке 1.
Пломбирование анализаторов не предусмотрено. Нанесение знака поверки на анализаторы не предусмотрено.
Программное обеспечение
Программное обеспечение НАНОФОР 05 используется для:
- проведения калибровок прибора (пространственная калибровка и спектральная калибровка)
- задания параметров экспериментов для проведения секвенирования или фрагментного анализа ДНК
- проведения процедур обслуживания прибора (замена полимера, замена линейки капилляров, удаление пузырей, выбор типа пластика и др.)
- вывода графика «сырых» данных по различным каналам флуоресценции
- вывода графика изменения напряжения, тока, температуры термостата
- генерации после окончания электрофореза файлов «сырых» данных с результатами секвенирования ДНК.
Программное обеспечение ДНК Анализ (сокращенное название - “ДНК Ал”) используется для первичного анализа данных секвенирования ДНК, обработки сырых данных, полученных путем электрофоретического разделения и детекции флуоресцентно меченых продуктов реакции секвенирования. В результате обработки сырых данных программа выдает последовательность ДНК в виде обработанной электрофореграммы, а также в виде текстовой последовательности.
Программное обеспечение ПАР2СЕК используется для анализа и редактирования результатов секвенирования ДНК, для вторичного анализа (например, выравнивания последовательностей ДНК) и редактирования данных секвенирования ДНК.
Программное обеспечение ДНК ФА используется для обработки данных фрагментного анализа ДНК. Программа метрологически не значима.
Защита ПО от непреднамеренных и преднамеренных изменений соответствует среднему уровню в соответствии с Р 50.2.077-2014.
Таблица 1 - Идентификационные данные программного обеспечения
| Идентификационные данные (признаки) | Значения |
| Идентификационное наименование ПО | НАНОФОР 05 | ДНК Анализ | ПАР2СЕК | ДНК ФА |
| Номер версии (идентификационный номер) ПО | не ниже 1.0.1.143 | не ниже 5.0.3.3 | не ниже 1.5.0 | не ниже 5.0.1.6 |
| Цифровой идентификатор ПО | 1C29DFC7BAA 549AEE21923A 647270DC8 | 5907C8F5609C 9BBB8303FB5 D27DFCAAC | 2A2A67A39DB 7A1C4E4323B BEDA0E3B3F | |
| Алгоритм вычисления цифрового идентификатора ПО | MD5 | MD5 | MD5 | |
| Примечание: метрологически значимый файл | SeqDataPro cessing.dll | seqmtl.dll. | SequenceLo gicData.dll | ПО не является метрологически значимым |
Технические характеристики
Таблица 2- Метрологические характеристики_
| Наименование характеристики | Значение |
| Диапазон измерений размера фрагмента последовательности ДНК, нуклеотидов, | от 1 до 750 |
| Пределы допускаемой относительной погрешности прочтения непрерывной последовательности ДНК (контрольный регион митохондриальной ДНК), % | ±1,5 |
| Диапазон измерений массовых долей нуклеотидов, % | от 0 до 100 |
| Пределы допускаемой относительной погрешности измерений массовых долей нуклеотидов, % | ±1,5 |
| Наименование характеристики | Значение |
| Напряжение источника бесперебойного питания, В | 230 |
| Потребляемая мощность источника бесперебойного питания, ВА, не более | 1500 |
| Габаритные размеры, мм, не более: высота длина ширина | 800 850 800 |
| Масса без запасных частей и принадлежностей, кг, не более | 80 |
| Условия эксплуатации: - температура окружающей среды, °С - относительная влажность (при температуре 25 °С без конденсации влаги) %, не более -атмосферное давление, кПа | от 15 до 30 80 от 97,3 до 105,3 |
| Время непрерывной работы, ч, не менее | 24 |
| Средняя наработка на отказ, ч, не менее | 2500 |
| Средний срок службы, лет, не менее | 5 |
Знак утверждения типа
Нанесение знака утверждения типа на анализаторы не предусмотрено. Знак утверждения типа наносится на титульный лист паспорта типографским способом.
Комплектность
Таблица 4 -Комплектность средства измерений
| Наименование | Обозначение | Количе ство |
| Анализаторы генетические капиллярного электрофореза Нанофор 05, системный блок, монитор, мышь и клавиатура с предустановленным программным обеспечением, источник бесперебойного питания, стартовый комплект расходных материалов и реактивов | - | 1 шт. |
| Паспорт | - | 1 экз. |
| Руководство по эксплуатации | - | 1 экз. |
| Ведомость ЗИП (стартового комплекта расходных материалов) | - | 1 экз. |
| Методика поверки | 009-24-19 МП | 1 экз. |
Сведения о методах измерений
Методы измерений содержатся в документе «Анализаторы генетические капиллярного электрофореза Нанофор 05. Руководство по эксплуатации», разделы 4, 5, 6.
Нормативные документы
ТУ 9443-005-04699534-2013 «Анализаторы генетические капиллярного электрофореза Нанофор 05. Технические условия»
81576-21: Методика поверки 009-24-19 МПСкачать7.0 Мб